fa بررسی تاثیر پنبه حاوی ژن chi بر روی جمعیت باکتریایی خاک تخصصي Special پژوهشي Research <div style="text-align: justify;"><span dir="RTL"><span style="font-family:b lotus;"><span style="font-size:12.0pt;">جمعیت‌های میکروبی عنصری کلیدی در کیفیت و حاصلخیزی خاک هستند. هدف این پژوهش مطالعه تاثیر پنبه تراریخته رقم کوکر حاوی ژن <span style="font-size:10px;"><em>chi&nbsp;</em></span></span></span></span><span dir="RTL"><span style="font-family:b lotus;"><span style="font-size:12.0pt;">لوبیا بر جمعیت‌های باکتریایی خاک بود.</span></span></span> <span dir="RTL"><span style="font-family:b lotus;"><span style="font-size:12.0pt;">لاین <span style="font-size:10px;"><span style="font-family:Times New Roman;">R8&nbsp;</span></span></span></span></span><span dir="RTL"><span style="font-family:b lotus;"><span style="font-size:12.0pt;">به عنوان گیاه تراریخته حامل ژن <span style="font-size:10px;"><em>chi&nbsp;</em></span></span></span></span><span dir="RTL"><span style="font-family: &quot;b lotus&quot;; font-size: 12pt;">حاصل از چهار بار تلاقی درون جمعیتی و لاین 1011 به عنوان شاهد غیر تراریخته (تیپ وحشی) تهیه شد و در گلخانه گیاهان تراریخته (سطح ایمنی 2) واقع در پژوهشکده بیوتکنولوژی کشاورزی ایران (</span><span style="font-size:10px;"><font face="times new roman, serif">ABRII</font></span></span><span dir="RTL"><span style="font-family: &quot;b lotus&quot;; font-size: 12pt;">) کشت شد. نمونه‌ برداری از خاک ناحیه ریزوسفر و بالک گیاهان 30، 60 و 90 روزه انجام شد. تعیین جمعیت باکتری کل و اکتینومیستها با استفاده از محیط </span><span style="font-size:10px;"><font face="times new roman, serif">TSA</font></span></span><span dir="RTL"><span style="font-family:b lotus;"><span style="font-size:12.0pt;">،</span></span></span> <span dir="RTL"><span style="font-family:b lotus;"><span style="font-size:12.0pt;">آب آگار و <span style="font-family:Times New Roman;"><span style="font-size:10px;">ISP2&nbsp;</span></span></span></span></span><span dir="RTL"><span style="font-family:b lotus;"><span style="font-size:12.0pt;">انجام شد. ماده وراثتی (دی ان ای) از یک گرم خاک و با استفاده از<span style="font-size:10px;"> Ultra Clean soil DNA</span> <span style="font-size:10px;">kit</span></span></span></span><span dir="RTL"><span style="font-family:b lotus;"><span style="font-size:12.0pt;"><span style="font-size:10px;">&nbsp;</span>استخراج شد. </span></span></span><span dir="RTL"><span style="font-family:b lotus;"><span style="font-size:12.0pt;">سپس <span style="font-size:10px;">PCR</span>-<span style="font-size:10px;">DGGE&nbsp;</span></span></span></span><span style="font-family:times new roman,serif;"><span style="font-size:10.0pt;">(<span style="font-size:10px;">Denaturing Gradient Gel Electrophoresis</span>)</span></span><span dir="RTL"><span style="font-family:b lotus;"><span style="font-size:12.0pt;"> برای نشان دادن تنوع</span></span></span> <span dir="RTL"><span style="font-family: &quot;b lotus&quot;; font-size: 12pt;">باکتریایی در نمونه‌های خاک انجام شد. تعداد کل باکتری‌های قابل کشت در نمونه‌های خاک 10⁶ و 10⁷ واحد تشکیل دهنده کلنی (</span><span style="font-size:10px;"><font face="times new roman, serif">CFU</font></span></span><span dir="RTL"><span style="font-family:b lotus;"><span style="font-size:12.0pt;">) در هر گرم خاک خشک به ترتیب برای خاک بالک و رایزوسفر بود. تعداد باکتری کل و اکتینومیستهای خاک رایزوسفر گیاهان 30 و 60 روزه تراریخته بیشتر از شاهد غیر تراریخته بود. اگرچه در پایان دوره رشد (90 روز پس از کشت بذر) جمعیت باکتریایی ‌گیاه تراریخته و غیر تراریخته برابر بود. بررسی مولکولی بر اساس </span></span></span><span style="font-family:times new roman,serif;"><span style="font-size:10.0pt;">PCR&ndash;DGGE</span></span><span dir="RTL"><span style="font-family:b lotus;"><span style="font-size:12.0pt;"> نیز الگوی مشابهی را برای جمعیت کل باکتریایی و اکتینومیستی مشخص کرد. </span></span></span><span dir="RTL"><span style="font-family:b lotus;"><span style="font-size:12.0pt;">نتایج ارائه شده در این پژوهش تفاوت معنی داری را بین تعداد باکتری کل و </span></span></span><span dir="RTL"><span style="font-family:b lotus;"><span style="font-size:12.0pt;">اکتینومیستی</span></span></span><span dir="RTL"><span style="font-family:b lotus;"><span style="font-size:12.0pt;"> موجود در خاک رایزوسفری و بالک پنبه تراریخته و غیر تراریخته در پایان دوره رشد گیاه (90 روز) نشان نداد. علاوه بر این به نظر می‌رسد دوره رشد گیاه تاثیر قابل توجه‌ای بر جمعیت میکروبی دارد. </span></span></span></div> <div style="text-align: justify;">Microbial communities are a key element of soil quality and fertility. This research aims to survey the effect of genetically modified cotton cultivar Coker, harbors an endochitinase gene (<em>chi</em>) from <em>Phaseolus vulgaris</em> (bean) on soil bacterial communities. The transgenic chi-resistant cotton (GM), line R8 was selfed for four generations and the corresponding original plant line 1011, wild-type (WT) were provided and planted in the transgenic greenhouse (Biosafety Level 2) at Agricultural Biotechnology Research Institute of Iran (ABRII). Samples of soil were collected from rhizosphere and bulk area of 30, 60 and 90 days old plants. Enumeration of total bacteria and Actinomycetes were carried out using TSA, Water Agar and ISP2 media. Soil DNA was extracted from 1-g samples by using an Ultra Clean soil DNA kit. PCR&ndash;DGGE (Denaturing Gradient Gel Electrophoresis) was performed to show diversity in different groups of bacteria. Total numbers of bacteria in soil samples was approximately 106 and 107 CFU/g of dried soil of rhizosphere and bulk soil respectively. Average number of total soil bacteria and Actinomycetes were higher in rhizosphere area of 30 and 60 days old GM plants compared to the control. Although, at the end of growth period (90 days) GM (transgenic) and non-GM plants were approximately equal in number of bacteria around their roots. Molecular analysis based on PCR-DGGE revealed similar microbial dynamics for both Actinomycetes and total batera. The data presented here showed no consistent statistically significant differences in the numbers of total bacteria and Actinomycetes between rhizosphere and bulk soil of chi and non-chi cotton at the end of the experiment. Furthermore, it seems that the growth stage of plant exerts a noticeable effect on the microbial community.</div> اکتینومیست, تراریخته, جمعیت باکتریایی, ریزوسفر, DGGE Actinomycetes, Transgenic, DGGE, Rhizosphere, Bacterial communities 1 10 http://journalofbiosafety.ir/browse.php?a_code=A-10-178-1&slc_lang=fa&sid=1 ebrahim karimi ابراهیم کریمی ekarimi@abrii.ac.ir 10031947532846002649 10031947532846002649 No M.Sc. of Plant Pathology, Agricultural Biotechnology Research Institute of Iran, Agricultural Research, Education and Extension Organization (AREEO), Karaj, Iran. کارشناس ارشد بیماری‌شناسی گیاهی، پژوهشکده بیوتکنولوژی کشاورزی ایران، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، کرج، ایران Masoud Tohidfar مسعود توحیدفر m_tohidfar@sbu.ac.ir 10031947532846002650 10031947532846002650 No Department of Biotechnology, Faculty of New Technologies and Energy Engineering, Shahid Beheshti University, Tehran, Islamic Republic of Iran. گروه مهندسی بیوتکنولوژی، دانشکده مهندسی انرژی و فناوری‌های نوین، دانشگاه شهید بهشتی Solmaz Khosravi سولماز خسروی khosravi@abrii.ac.ir 10031947532846002651 10031947532846002651 No Instructor of Agricultural Biotechnology, Agricultural Biotechnology Research Institute of Iran, Agricultural Research, Education and Extension Organization (AREEO), Karaj, Iran مربی پژوهشی بیوتکنولوژی کشاورزی، پژوهشکده بیوتکنولوژی کشاورزی ایران، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، کرج، ایران akram sadeghi اکرم صادقی aksadeghi@abrii.ac.ir 10031947532846002652 10031947532846002652 Yes Assistant Professor of Molecular Genetics, Agricultural Biotechnology Research Institute of Iran, Agricultural Research, Education and Extension Organization (AREEO), Karaj, Iran. استادیار ژنتیک مولکولی، پژوهشکده بیوتکنولوژی کشاورزی ایران، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، کرج، ایران