Journal of Biosafety

fa آشنایی با نرم‌افزار GMOseek به‌منظور شناسایی و بررسی موجودات تراریخته Study of GMOseek software in order to detection of genetically modified organisms تخصصي Special كاربردي Applicable <div style="text-align: justify;">با توجه به سرعت فزاینده تایید و تجاری‌سازی محصولات تراریخته در سراسر جهان، آزمایش‌های مربوط به شناسایی این محصولات در غذا، علوفه و نمونه‌های بذری با توجه به مقررات مربوط، بسیار مشکل و هزینه‌بر خواهد بود. بسیاری از روش‌های تشخیصی در حال حاضر با توجه به بودجه محدود متناسب با منابع در دسترس، برای افزایش بهره‌وری از نرم‌افزارهای مبتنی بر جدول ماتریسی از داده‌ها "رویکرد ماتریسی" استفاده می‌نمایند. در بسیاری از مواقع رویکرد ماتریسی با استفاده از ابزار محاسباتی خاص و اطلاعات بسیار اندک، در جهت استفاده کارآمد از داده‌های موجود قابل اجرا است. نرم‌افزار توسعه‌یافته GMOseek برای پشتیبانی از تصمیم‌گیری‌های انجام شده در تمامی مراحل آزمایش‌های تشخیص موجودات تراریخته، از جمله تفسیر نتایج خام آزمایشگاهی طراحی شده است. این نرم‌افزار از جدول ماتریسی رخداد (event) و عناصر ژنتیکی مربوط به آنها و اطلاعات موجود در مورد نمونه استفاده می‌کند. این ابزار با استفاده از استراتژی بهینه‌سازی، روش‌های غربالگری مناسب‌تری برای نمونه پیشنهاد می‌دهد. در ادامه، نرم‌افزار GMOseek اجازه می‌دهد تا کاربر به دلخواه به جستجوی ترکیب مقرون به صرفه‌ای از تست‌های غربالگری بر روی نمونه خاص تراریخته بپردازد. بعلاوه این نرم‌افزار به کاربر امکان انتخاب تجزیه و تحلیل مناسب برای تعیین حضور یک رخداد به خصوص در نمونه مورد بررسی را می‌دهد. </div> <div style="text-align: justify;">Due to the increasing speed of approval and commercialization of GM crops around the world, matching tests for food, feed and seed samples according to relevant regulations will be very difficult and very expensive. Many of them have already adopted the so called “matrix approach” to rationalize the resources and efforts used to increase their efficiency within a limited budget. Most of the time, the “matrix approach” is implemented using limited information and some proprietary computational tool to efficiently use the available data. The tool makes use of a tabulated matrix of GM events and their genetic elements, of the laboratory analysis history and the available information about the sample at hand. The tool uses an optimization approach to suggest the most suited screening assays for the given sample. The practical GMOseek user interface allows the user to customize the search for a cost-efficient combination of screening assays to be employed on a given sample. It further guides the user to select appropriate analyses to determine the presence of individual GM events in the analyzed sample.</div> موجودات تراریخته, رویکرد ماتریسی, بهینه‌سازی, هزینه یک روش کارآمد Genetically Modified Organism, Matrix approach, Constraint optimization, Cost efficient GMO testing 125 134 http://journalofbiosafety.ir/browse.php?a_code=A-10-188-2&slc_lang=fa&sid=1 Maryam Zakavi مریم زکوی maryam.1987z@yahoo.com 10031947532846002645 10031947532846002645 No PhD graduated, Department of Biotechnology, Faculty of Engineering and New Technologies, Shahid Behesgti University, Teharn, Iran دانش آموخته دکتری بیوتکنولوژی، دانشکده مهندسی انرژی و فناوریهای نوین، دانشگاه شهید بهشتی، تهران، ایران Masoud Tohidfar مسعود توحیدفر M_Tohidfar@sbu.ac.ir 10031947532846002646 10031947532846002646 Yes Associate Professor, Department of Biotechnology, Faculty of Engineering and New Technologies, Shahid Behesgti University, Teharn, Iran انشیار دانشکده فناوریهای نوین، دانشکده مهندسی انرژی و فناوریهای نوین، دانشگاه شهید بهشتی، تهران، ایران