Journal of Biosafety
فصلنامه علمي ايمني زيستي
Journal of Biosafety
Basic Sciences
http://journalofbiosafety.ir
1
admin
2717-0632
2716-9804
4
4
fa
jalali
1396
8
1
gregorian
2017
11
1
10
3
online
1
fulltext
fa
آشنایی با نرمافزار GMOseek بهمنظور شناسایی و بررسی موجودات تراریخته
Study of GMOseek software in order to detection of genetically modified organisms
تخصصي
Special
كاربردي
Applicable
<div style="text-align: justify;"><span style="font-family:b lotus;"><span style="font-size:12.0pt;">با توجه به سرعت فزاینده تایید و تجاری­سازی محصولات تراریخته در سراسر جهان، آزمایش­های مربوط به شناسایی این محصولات در غذا، علوفه و نمونه­های بذری با توجه به مقررات مربوط، بسیار مشکل و هزینه­بر خواهد بود. بسیاری از روش­های تشخیصی در حال حاضر با توجه به بودجه محدود متناسب با منابع در دسترس، برای افزایش بهره­وری از نرمافزارهای مبتنی بر جدول ماتریسی از داده­ها "رویکرد ماتریسی" استفاده می­نمایند. در بسیاری از مواقع رویکرد ماتریسی با استفاده از ابزار محاسباتی خاص و اطلاعات بسیار اندک، در جهت استفاده کارآمد از داده­های موجود قابل اجرا است. نرم­افزار توسعه­یافته </span></span><span dir="LTR"><span style="font-family:times new roman,serif;"><span style="font-size:10.0pt;">GMOseek</span></span></span><span style="font-family:b lotus;"><span style="font-size:12.0pt;"> برای پشتیبانی از تصمیم­گیری­های انجام شده در تمامی مراحل آزمایش­های تشخیص موجودات تراریخته، از جمله تفسیر نتایج خام آزمایشگاهی طراحی شده است. این نرمافزار از جدول ماتریسی رخداد</span></span> <span style="font-family:b lotus;"><span style="font-size:12.0pt;">(</span></span><span dir="LTR"><span style="font-family:times new roman,serif;"><span style="font-size:10.0pt;">event</span></span></span><span style="font-family:b lotus;"><span style="font-size:12.0pt;">) و عناصر ژنتیکی مربوط به آن­ها و اطلاعات موجود در مورد نمونه استفاده می­کند. این ابزار با استفاده از استراتژی بهینه­سازی، روش­های غربالگری مناسب­تری برای نمونه پیشنهاد می­دهد. در ادامه، نرمافزار </span></span><span dir="LTR"><span style="font-family:times new roman,serif;"><span style="font-size:10.0pt;">GMOseek</span></span></span><span style="font-family:b lotus;"><span style="font-size:12.0pt;"> اجازه می­دهد تا کاربر به دلخواه به جستجوی ترکیب مقرون به صرفهای از تست­های غربالگری بر روی نمونه خاص تراریخته بپردازد. بعلاوه این نرم­افزار به کاربر امکان انتخاب تجزیه و تحلیل مناسب برای تعیین حضور یک رخداد به خصوص در نمونه مورد بررسی را می­دهد. </span></span></div>
<div style="text-align: justify;">Due to the increasing speed of approval and commercialization of GM crops around the world, matching tests for food, feed and seed samples according to relevant regulations will be very difficult and very expensive. Many of them have already adopted the so called “matrix approach” to rationalize the resources and efforts used to increase their efficiency within a limited budget. Most of the time, the “matrix approach” is implemented using limited information and some proprietary computational tool to efficiently use the available data. The tool makes use of a tabulated matrix of GM events and their genetic elements, of the laboratory analysis history and the available information about the sample at hand. The tool uses an optimization approach to suggest the most suited screening assays for the given sample. The practical GMOseek user interface allows the user to customize the search for a cost-efficient combination of screening assays to be employed on a given sample. It further guides the user to select appropriate analyses to determine the presence of individual GM events in the analyzed sample.</div>
موجودات تراریخته, رویکرد ماتریسی, بهینهسازی, هزینه یک روش کارآمد
Genetically Modified Organism, Matrix approach, Constraint optimization, Cost efficient GMO testing
125
134
http://journalofbiosafety.ir/browse.php?a_code=A-10-188-2&slc_lang=fa&sid=1
Maryam
Zakavi
مریم
زکوی
maryam.1987z@yahoo.com
10031947532846002645
10031947532846002645
No
PhD graduated, Department of Biotechnology, Faculty of Engineering and New Technologies, Shahid Behesgti University, Teharn, Iran
دانش آموخته دکتری بیوتکنولوژی، دانشکده مهندسی انرژی و فناوریهای نوین، دانشگاه شهید بهشتی، تهران، ایران
Masoud
Tohidfar
مسعود
توحیدفر
M_Tohidfar@sbu.ac.ir
10031947532846002646
10031947532846002646
Yes
Associate Professor, Department of Biotechnology, Faculty of Engineering and New Technologies, Shahid Behesgti University, Teharn, Iran
انشیار دانشکده فناوریهای نوین، دانشکده مهندسی انرژی و فناوریهای نوین، دانشگاه شهید بهشتی، تهران، ایران