fa توالی‌یابی نسل جدید و برهمکنش‌های ذاتی ویروس-ویروس و ویروس-گیاه تخصصي Special كاربردي Applicable <div style="text-align: justify;"><span dir="RTL"><span style="font-family:B Lotus;"><span style="font-size:14.0pt;">برای درک اکولوژی ویروس‌ها، لازم است تا اطلاعات جامع در خصوص برهمکنش‌های ویروس-ویروس و ویروس-میزبان در سیستم‌های طبیعی به‌دست آید. در این مطالعه، مشخص شده است که فناوری توالی‌یابی آر.ان.ای (RNA-Seq)، امکان&nbsp;این تحلیل را بدون مفروضات قبلی در خصوص آلودگی‌ها و علائم ویروسی یا ژن‌های میزبان فراهم می‌کند. توالی‌یابی نسل جدید امکان شناسایی بالقوه‌ی آلودگی‌های چندگانه را تسهیل می‌کند. پاسخ‌های ضد ویروسی میزبان به واسطه‌ خاموشی آر.ان.اِ، تحت شرایط طبیعی اتفاق می‌افتد. از آنجایی‌که تحقیقات درزمینه‌ ویروس‌های گیاهی به‌طور عمده بر بیماری‌های گیاهان زراعی متمرکز بوده‌اند، اطلاعات کمی در خصوص این ویروس‌ها در محیط‌های طبیعی وجود دارد. توالی‌یابی آر.ان.اِ در گیاهان مربوط به یک جمعیت طبیعی برای تعیین هم‌زمان حضور و عدم حضور همه‌ی ویروس‌هایی که توالی آن‌ها گزارش شده است، شناسایی ویروس‌های جدید و سنجش کمّی ترانسکریپتوم میزبان مورد استفاده قرار می‌گیرد. با معرفی معیارهای تعداد خوانش و پوشش ژنوم، آلودگی‌های ناشی از ویروس آشکار شده و برهمکنش‌های ذاتی و پنهان گیاه-ویروس می‌تواند کاربردهای مهمی در کنترل این عوامل بیماری‌زا داشته باشد.</span></span></span></div> <div style="text-align: justify;">In order to understand the ecology of viruses, it is necessary to obtain comprehensive information on virus-virus and virus-host interactions in natural systems. In this study, it is found that RNA-Seq enabled this analysis without prior assumptions about infectious viruses, virus symptoms, or host genes. New generation sequencing allows identifying potential facilitators of multiple infections. Host antiviral responses occur naturally under RNA silencing. Because research into plant viruses has focused primarily on crop diseases, little is known about these viruses in the wild. RNA sequencing in plants belonging to a natural population is used to determine the simultaneous presence or absence of all viruses whose sequence has been reported, to identify new viruses, and to quantify host transcriptomes. By introducing the criteria for the number of readings and coverage of the genome, virus-induced infections and intrinsic and latent plant-virus interactions can have important applications in controlling these pathogens.</div> اکولوژی, ترانسکریپتوم, خاموشی آر.ان.اِ, RNA-Seq Ecology, RNA-Seq, RNA Silencing, Transcriptome. 77 96 http://journalofbiosafety.ir/browse.php?a_code=A-10-290-3&slc_lang=fa&sid=1 Saeedeh Dehghanpour Farashah سعیده دهقانپور فراشاه sdfarashah@yahoo.com 10031947532846002200 10031947532846002200 No Assistant Professor, Department of Agriculture, Payame Noor University, Tehran, Iran. 1- استادیار گروه کشاورزی، دانشگاه پیام نور، تهران، ایران Mehrdad Salehzadeh مهرداد صالح زاده mehrdadsalehzadeh@gmail.com 10031947532846002201 10031947532846002201 Yes PhD. Student of Plant Pathology, Faculty of Agriculture, Shiraz University, Iran. دانشجوی دکترای بیماری‌شناسی گیاهی، دانشکده‌ی کشاورزی، دانشگاه شیراز، ایران Ahmad Ashrafi احمد اشرفی Traiding.ashrafi@gmail.com 10031947532846002202 10031947532846002202 No MSc. of Plant Pathology, Department of Agriculture, The universityof Malekan Azad, Iran. کارشناسی‌ارشد، بیماری‌شناسی گیاهی، دانشکده‌ی کشاورزی ، دانشگاه آزاد واحد ملکان، ایران