:: دوره 13، شماره 4 - ( 12-1399 ) ::
جلد 13 شماره 4 صفحات 95-118 برگشت به فهرست نسخه ها
کاربرد فناوری نسل جدید توالی‌یابی در ویروس‌شناسی گیاهی
فرشته اسماعیل زاده، داود کولیوند*
دانشیار بیماری‌شناسی گیاهی، گروه گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه زنجان، زنجان، ایران
چکیده:   (526 مشاهده)
پیشرفت علم با ظهور فناوری‌هایی که راه‌های جدیدی را برای پاسخ به سوالات علمی و پیشرفت دانش فراهم می‌کنند، امکان‌پذیر است. پس از روش‌های بیولوژیکی، سرولوژیکی و مولکولی، فناوری نسل جدید توالی‌یابی (NGS) یکی از روش‌هایی است که اکنون درک ویروس‌ها را به ویژه در زمینه‌های شناسایی، توالی‌یابی ژنوم و ترنسکریپتوم، تکامل، تاکسونومی و اقدامات قرنطینه‌ای تغییر می‌دهد. این روش در کنار مشکلاتی چون ذخیره‌سازی، تفسیر حجم عظیمی از داده‌های تولیدشده، با شناسایی محتوای کل ویروسی و ترنسکریپتوم نمونه گیاهی در شرایط بیمار و سالم، تشخیص و شناسایی همه ویروس‌های شناخته‌شده و ناشناخته موجود در یک گیاه را بدون نیاز به دانش قبلی از بیمارگر مورد نظر فراهم می‌کند. سرعت شناسایی ویروس‌ها، ویروئیدها و میزبان‌های جدید را افزایش داده و با تشخیص به موقع می‌تواند از ورود ویروس‌ها و ویروئیدهای خارجی به مناطق جدید جلوگیری کند. شناسایی دقیق‌تر و سریعتر ویروسهای گیاهی و اثرات کامل آنها در میزبان‌های مختلف یکی از مهمترین گامهای مدیریت بیماریهاست. در این مقاله، با مروری بر کاربردهای NGS در تشخیص و شناسایی ویروس‌ها، شناسایی بیماری‌ها با اتیولوژی ناشناخته، اثرات متقابل میزبان و بیمارگر و موارد دیگر را مورد بحث قرار خواهیم داد.
واژه‌های کلیدی: ترنسکریپتوم، شناسایی، قرنطینه، ویروس
متن کامل [PDF 2037 kb]   (176 دریافت)    
نوع مطالعه: پژوهشي | موضوع مقاله: تخصصي
دریافت: 1400/1/12 | پذیرش: 1400/1/30 | انتشار: 1400/1/30


XML   English Abstract   Print



بازنشر اطلاعات
Creative Commons License این مقاله تحت شرایط Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License قابل بازنشر است.
دوره 13، شماره 4 - ( 12-1399 ) برگشت به فهرست نسخه ها