fa اصول و نکات طراحی آغازگر جهت واکنش زنجیره ای پلیمراز تخصصي Special كاربردي Applicable <span style="font-family:b lotus;"><span style="font-size:12.0pt;">در مهندسی ژنتیک، آغازگر به یک قطعه&shy; ی الیگونوکلئوتیدی (26-18جفت باز) اطلاق می&shy;شود که توانایی اتصال به دی.ان.ا هدف را داشته و نقشی حیاتی در اختصاصیت واکنش </span></span><span dir="LTR"><span style="font-family:times new roman,serif;"><span style="font-size:10.0pt;">PCR</span></span></span><span style="font-family:b lotus;"><span style="font-size:12.0pt;"> ایفا می&shy; کند. یکی از مهمترین معیارهایی که بر موفقیت فرآیند </span></span><span dir="LTR"><span style="font-family:times new roman,serif;"><span style="font-size:10.0pt;">PCR</span></span></span><span style="font-family:b lotus;"><span style="font-size:12.0pt;"> تاثیرگذار است، طراحی یک آغازگر مناسب است. اگر تمامی شرایط برای یک </span></span><span dir="LTR"><span style="font-family:times new roman,serif;"><span style="font-size:10.0pt;">PCR</span></span></span><span style="font-family:b lotus;"><span style="font-size:12.0pt;"> خوب فراهم باشد، ولی فقط از یک آغازگر نامناسب استفاده شود، در انتهای کار، محصول بسیار اندک با ناخالصی&shy; های فراوان تولید می&shy;شود، یا ممکن است هیچ محصولی تولید نشود. این پدیده می&shy;تواند به علت اتصالات غیر اختصاصی آغازگر به الگو و یا تشکیل دایمر آغازگر اتفاق بیفتد. برای طراحی یک آغازگر کارا برای فرآیند </span></span><span dir="LTR"><span style="font-family:times new roman,serif;"><span style="font-size:10.0pt;">PCR</span></span></span><span style="font-family:b lotus;"><span style="font-size:12.0pt;">، باید پارامترهای متنوعی را همچون طول آغازگر، دمای ذوب </span></span><span dir="LTR"><span style="font-family:times new roman,serif;"><span style="font-size:10.0pt;">(Thermal Melting)</span></span></span><span style="font-family:b lotus;"><span style="font-size:12.0pt;">، میزان </span></span><span dir="LTR"><span style="font-family:times new roman,serif;"><span style="font-size:10.0pt;">GC</span></span></span><span style="font-family:b lotus;"><span style="font-size:12.0pt;">، انتهای </span></span><span style="font-family:arial,sans-serif;"><span style="font-size:12.0pt;">ˊ</span></span><span style="font-family:b lotus;"><span style="font-size:12.0pt;">3 آغازگر، انتهای</span></span><span style="font-family:arial,sans-serif;"><span style="font-size:12.0pt;">ˊ</span></span><span style="font-family:b lotus;"><span style="font-size:12.0pt;">5 آغازگر، تشکیل آغازگردایمر، تشکیل حلقه و ساختارهای سنجاق&shy; سری را مورد توجه و بررسی قرار داد. در این مقاله سعی شده اصول و نکات طراحی یک آغازگر مناسب شرح داده شود و تمامی پارامترها مورد بحث قرار گیرد.</span></span> In genetic engineering, Primer is an oligonucleotide with 18-26 base pair (bp) that attached to target DNA and have a critical role in the specificity of the PCR reaction. An appropriate primer design is one of the most important factor for good PCR. A poorly designed primer can result in little or no target product, due to non-specific amplification or primer dimer formation leading to reaction failure, even when all the other parameters are properly optimized. There are number of criteria such as primer length, Tm, GC contents, 3&#39;-end sequence, 5&#39;-end sequence, primer-dimer formation, hairpin-loop structure formation that need to be established in the design of primers to have efficient primers for PCR reaction. This article provides general guidelines for PCR primer design<strong>.</strong> طراحی آغازگر, PCR, دایمرآغازگر, ساختار سنجاق سری Primer design, PCR, Primer dimer, Hairpin 85 91 http://journalofbiosafety.ir/browse.php?a_code=A-10-121-1&slc_lang=fa&sid=1 Seyed mohammad gheibi Hayat سید محمد غیبی حیات gheibi65@yahoo.com 1003194753284600945 1003194753284600945 Yes Young Researchers and Elite Club of Islamic Azad University, Andimeshk Branch, Andimeshk, Iran باشگاه پژوهشگران و نخبگان جوان دانشگاه آزاد اسلامی، واحد اندیمشک، اندیمشک، ایران kazem Abbaszadeh Goudarzi کاظم عباس زاده گودرزی pajoohan@gmail.com 1003194753284600946 1003194753284600946 No Biotechnology, Faculty of Advanced Medical Technology, Tehran University of Medical Sciences, Tehran, Iran دانشکده فناوری های پیشرفته پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی تهران، تهران، ایران Hekmat allah Moradi Mogarmon حکمت الله مرادی موگرمون morad2063@yahoo.com 1003194753284600947 1003194753284600947 No Shiraz University of Medical Sciences, Research Center for Clinical Education Quality Improvement, School of Medicine, Shiraz, Iran دانشگاه علوم پزشکی شیراز، مرکز تحقیقات ارتقاء کیفیت آموزش بالینی، دانشکده پزشکی، شیراز، ایران