fa آنالیز شبکه همبستگی ژن‌های پاسخ دهنده به تنش شوری در گیاه Suaeda salsa تخصصي Special پژوهشي Research <div style="text-align: justify;"><span dir="RTL" lang="AR-SA" style="font-size:12.0pt"><span b="" lotus="" style="font-family:">تنش شوری یکی از مهترین تنش‌های غیرزیستی است که منجر به خسارات قابل توجهی در تولید محصولات کشاورزی به‌ویژه در مناطق خشک و نیمه‌خشک می‌شود. به منظور شناسایی ژن‌های کلیدی درگیر در تحمل به شوری، </span></span><i><span style="font-size:10.0pt"><span new="" roman="" style="font-family:" times="">Suaeda slsa</span></span> </i><span dir="RTL" lang="AR-SA" style="font-size:12.0pt"><span b="" lotus="" style="font-family:">با ظرفیت سازگاری با سطوح شوری بالا، در سطح ترنسکریپتوم مورد بررسی قرار گرفت. توالی‌یابی </span></span><span style="font-size:10.0pt"><span new="" roman="" style="font-family:" times="">RNA</span></span><span dir="RTL" lang="AR-SA" style="font-size:12.0pt"><span b="" lotus="" style="font-family:">، در سطوح شوری 0، 200، 400 و 800 میلی مولار توصیف کارآمدی را از پروفایل‌ بیان ژن‌ها، در طول تنش نشان داد. با این حال، این بررسی‌ها معمولاً بر غربالگری ژن‌ها با بیان متفاوت تمرکز می‌کنند و میزان همبستگی بین ژن‌های درگیر در تنش شوری را مورد بررسی قرار نمی‌دهند. بنابراین در این تحقیق، شبکه همبستگی 50 ژن کاندیدای پاسخ دهنده به تنش شوری با</span></span><span style="font-size:10.0pt"><span new="" roman="" style="font-family:" times="">logFC>2</span></span><span dir="RTL" lang="AR-SA" style="font-size:12.0pt"><span b="" lotus="" style="font-family:"> درمقایسه با شاهد مورد بررسی قرار گرفت. شبکه همبستگی حاصل از 848 برهمکنش ژنی نشان داد که این ژن ها می توانند در سه کلاستر طبقه بندی شوند. آنالیز هستی شناسی و مسیر های عملکردی ژن ها با استفاده از پایگاه داده </span></span><span style="font-size:10.0pt"><span new="" roman="" style="font-family:" times="">KEGG</span></span><span dir="RTL" lang="AR-SA" style="font-size:12.0pt"><span b="" lotus="" style="font-family:"> نشان داد متابولیسم گلی‌اگزالات و دی کربوکسیلات تنها مسیر غنی شده در پاسخ به تنش شوری است.</span></span></div> <div><br> &nbsp;</div> <div style="text-align: justify;"><span style="font-size:12pt"><span style="background:white"><span style="line-height:normal"><span style="unicode-bidi:embed"><span new="" roman="" style="font-family:" times=""><span style="font-size:10.0pt"><span style="color:black">Salinity stress is a significant abiotic factor causing substantial reductions in agricultural crop yields, particularly in arid and semi-arid regions. To identify key genes associated with salinity tolerance, Suaeda salsa, a species known for its ability to thrive in high-salinity environments, was studied at the transcriptome level. RNA sequencing was conducted under NaCl concentrations of 0, 200, 400, and 800 mM to profile gene expression during salinity stress. While these studies often emphasize differentially expressed genes, the interaction dynamics among genes under salinity stress remain underexplored. To address this, a correlation network was constructed for 50 selected genes (logFC>2, salinity vs. control) with 848 interactions, grouped into three clusters. Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (KEGG) analysis revealed that glyoxylate and dicarboxylate metabolism was the sole enriched pathway during salinity stress.</span></span><span style="font-size:10.0pt"></span></span></span></span></span></span><br> &nbsp;</div> تنش‌های غیرزیستی, توالی‌یابی RNA, شورزی RNA sequencing, Abiotic stress, Halophyte 78 92 http://journalofbiosafety.ir/browse.php?a_code=A-10-882-1&slc_lang=fa&sid=1 shima jamalirad شیما جمالی راد Shimajamalirad21@gmail.com 10031947532846003984 10031947532846003984 No Department of Plant Production and Genetics, Faculty of Agriculture, Zanjan University, Zanjan, Iran گروه مهندسی تولید و ژنتیک گیاهی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه زنجان، زنجان، ایران Mohammad Reza Azimi محمد رضا عظیمی azimi@znu.ac.ir 10031947532846003985 10031947532846003985 No Department of Plant Production and Genetics, Faculty of Agriculture, Zanjan University, Zanjan, Iran گروه مهندسی تولید و ژنتیک گیاهی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه زنجان، زنجان، ایران Mohammad Reza ghaffari محمد رضا غفاری mrghaffari52@gmail.com 10031947532846003986 10031947532846003986 Yes Department of System Biology, Agricultural Biotechnology Research Institute of Iran(ABRII), Karaj, Iran بخش زیست شناسی سامانه‌ها، پژوهشگاه بیوتکنولوژی و کشاورزی کرج، کرج، ایران