بخش زیست شناسی سامانهها، پژوهشگاه بیوتکنولوژی و کشاورزی کرج، کرج، ایران
چکیده: (1570 مشاهده)
تنش شوری یکی از مهترین تنشهای غیرزیستی است که منجر به خسارات قابل توجهی در تولید محصولات کشاورزی بهویژه در مناطق خشک و نیمهخشک میشود. به منظور شناسایی ژنهای کلیدی درگیر در تحمل به شوری، Suaeda slsaبا ظرفیت سازگاری با سطوح شوری بالا، در سطح ترنسکریپتوم مورد بررسی قرار گرفت. توالییابی RNA، در سطوح شوری 0، 200، 400 و 800 میلی مولار توصیف کارآمدی را از پروفایل بیان ژنها، در طول تنش نشان داد. با این حال، این بررسیها معمولاً بر غربالگری ژنها با بیان متفاوت تمرکز میکنند و میزان همبستگی بین ژنهای درگیر در تنش شوری را مورد بررسی قرار نمیدهند. بنابراین در این تحقیق، شبکه همبستگی 50 ژن کاندیدای پاسخ دهنده به تنش شوری باlogFC>2 درمقایسه با شاهد مورد بررسی قرار گرفت. شبکه همبستگی حاصل از 848 برهمکنش ژنی نشان داد که این ژن ها می توانند در سه کلاستر طبقه بندی شوند. آنالیز هستی شناسی و مسیر های عملکردی ژن ها با استفاده از پایگاه داده KEGG نشان داد متابولیسم گلیاگزالات و دی کربوکسیلات تنها مسیر غنی شده در پاسخ به تنش شوری است.
jamalirad S, Azimi M R, ghaffari M R. Correlation Network analysis of Genes Responding to Salinity Stress in Suaeda salsa. Journal of Biosafety 2024; 17 (1) :78-92 URL: http://journalofbiosafety.ir/article-1-571-fa.html
جمالی راد شیما، عظیمی محمد رضا، غفاری محمد رضا. آنالیز شبکه همبستگی ژنهای پاسخ دهنده به تنش شوری در گیاه Suaeda salsa. فصلنامه علمي ايمني زيستي. 1403; 17 (1) :78-92
