بخش زیست شناسی سامانه‌ها، پژوهشگاه بیوتکنولوژی و کشاورزی کرج، کرج، ایران
چکیده: (402 مشاهده)
تنش شوری یکی از تنش‌های غیرزیستی رایج است که منجر به خسارات قابل توجهی در تولید محصولات کشاورزی به‌ویژه در مناطق خشک و نیمه‌خشک می‌شود. به منظور شناسایی ژن‌های کلیدی درگیر در تحمل به شوری، Suaeda slsa با ظرفیت سازگاری با سطوح شوری بالا، در سطح ترنسکریپتوم مورد بررسی قرار گرفت. توالی‌یابی آران‌اِ، در سطوح شوری 0، 200، 400 و 800 میلی‌مولار توصیف کارآمدی را از پروفایل بیان ژن‌ها، در طول تنش ایجاد کرد. با این حال، این بررسی‌ها معمولاً بر غربالگری ژن‌ها با بیان متفاوت تمرکز می‌کنند و درجه ارتباط بین ژن‌های درگیر در تنش شوری را مورد بررسی قرار نمی‌دهند. برای این منظور، شبکه همبستگی 50 ژن پاسخ دهنده به تنش شوری با استفاده از نرم افزاز Cytoscape ترسیم شد که در آن ژن‌ها در سه کلاستر مختلف دسته‌بندی شدند. برای رسم ماژول‌ها نیز از آستانه r>0.95 و P-value<0.01 استفاده شد و از 50 ژن انتخابی برای رسم شبکه، 31 ژن در 4 ماژول مختلف قرار گرفتند که بیشترین تعداد مربوط به ماژول قرمز رنگ (15 ژن) بود. آنالیز KEGG برای کلیه ماژول‌ها نشان داد که متابولیسم گلی‌اگزالات و دی کربوکسیلات تنها مسیر غنی شده در پاسخ به تنش شوری بود که در ماژول قرمز رنگ یافت شد.
jamalirad S, Azimi M R, ghaffari M R. Correlation Network of Genes Responding to Salinity Stress in Suaeda salsa. Journal of Biosafety 2024; 17 (1) URL: http://journalofbiosafety.ir/article-1-571-fa.html
جمالی راد شیما، عظیمی محمد رضا، غفاری محمد رضا. شبکه همبستگی ژن‌های پاسخ دهنده به تنش شوری در گیاه Suaeda salsa. فصل‌نامه علمي ايمني زيستي. 1403; 17 (1)
