دانشیار بیماری‌شناسی گیاهی، گروه گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه زنجان، زنجان، ایران
چکیده: (2140 مشاهده)
پیشرفت علم با ظهور فناوری‌هایی که راه‌های جدیدی را برای پاسخ به سوالات علمی و پیشرفت دانش فراهم می‌کنند، امکان‌پذیر است. پس از روش‌های بیولوژیکی، سرولوژیکی و مولکولی، فناوری نسل جدید توالی‌یابی (NGS) یکی از روش‌هایی است که اکنون درک ویروس‌ها را به ویژه در زمینه‌های شناسایی، توالی‌یابی ژنوم و ترنسکریپتوم، تکامل، تاکسونومی و اقدامات قرنطینه‌ای تغییر می‌دهد. این روش در کنار مشکلاتی چون ذخیره‌سازی، تفسیر حجم عظیمی از داده‌های تولیدشده، با شناسایی محتوای کل ویروسی و ترنسکریپتوم نمونه گیاهی در شرایط بیمار و سالم، تشخیص و شناسایی همه ویروس‌های شناخته‌شده و ناشناخته موجود در یک گیاه را بدون نیاز به دانش قبلی از بیمارگر مورد نظر فراهم می‌کند. سرعت شناسایی ویروس‌ها، ویروئیدها و میزبان‌های جدید را افزایش داده و با تشخیص به موقع می‌تواند از ورود ویروس‌ها و ویروئیدهای خارجی به مناطق جدید جلوگیری کند. شناسایی دقیق‌تر و سریع‌تر ویروس‌های گیاهی و اثرات کامل آنها در میزبان‌های مختلف یکی از مهمترین گام‌های مدیریت بیماری‌هاست. در این مقاله، با مروری بر کاربردهای NGS در تشخیص و شناسایی ویروس‌ها، شناسایی بیماری‌ها با اتیولوژی ناشناخته، اثرات متقابل میزبان و بیمارگر و موارد دیگر را مورد بحث قرار خواهیم داد.
Esmaeilzadeh F, Koolivand D. Application of Next Generation Sequencing Technologies in Plant Virology. Journal of Biosafety 2021; 13 (4) :95-118 URL: http://journalofbiosafety.ir/article-1-395-fa.html
