استادیار گروه زیست شناسی، دانشکده علوم پایه، دانشگاه شهید مدنی آذربایجان، تبریز، ایران
چکیده: (1112 مشاهده)
باکتری‌های جنس Leuconostoc جزئی از میکروفلور طبیعی اغلب مزارع کشاورزی و محصولات تخمیری هستند. آلودگی توسط انواع دی.ان.ای مهاجم خارجی منجر به شکست فرآیند تخمیر می‌شود. سیستم CRISPER/Cas از اجزای اصلی سیستم ایمنی باکتری‌ها است. در این مطالعه مسیر تکاملی سویه‌های مختلف جنس لوکونوستوک بر مبنای وقایع ترکیب، حذف و اضافه‌شدگی توالی‌های فاصله‌انداز تحت شرایط فشار انتخابی ارزیابی و تنوع فاژها و پلاسمیدهای مهاجم هدف قرار داده شده توسط سیستم CRISPER/Cas سویه‌های جنس Leuconostoc مطالعه شد. بیشترین تشابه از نظر ترکیب توالی تشکیل‌دهنده فاصله‌انداز‌ها و وقایع اضافه‌شدگی و حذف در فاصله‌انداز‌ها در دو گونه Leuconostoc pseudomesentriodes و Leuconostoc gelidum مشاهده شد. تعداد 45 فاصله‌انداز از سویه AMKR21 گونه L. gelidum فاژ Alteromonas phage JH01 را هدف قرار دادند که بیشترین میزان تطابق با فاژها بود. همچنین بیشترین تعداد انواع فاژ دارای تطابق، مربوط به فاژهای Escherchia phage بود. در مورد هدف‌گیری پلاسمیدهای مهاجم، 177 مورد هدف‌گیری پلاسمیدهایی از Leuconostoc citreum توسط سویه NBRC113246 گونه L. gelidum شناسایی شد که بیشترین میزان مطابقت در بین سویه‌های مختلف بود. نتایج این مطالعه اهمیت سیستم‌های ایمنی تطبیقی باکتریایی در پایداری در محیط‌های حاوی باکتریوفاژ و نیز بهره‌برداری از این اطلاعات در تعریف فرمولاسیون‌های کاربردی را آشکار کرد.
Ghaffarian S, Panahi B. Investigating the diversity of phage and plasmid targets of the CRISPR/Cas systems in the Leuconostoc genus using the insilico approach. Journal of Biosafety 2023; 16 (1) :15-36 URL: http://journalofbiosafety.ir/article-1-510-fa.html
غفاریان سارا، پناهی بهمن. بررسی تنوع اهداف فاژی و پلاسمیدی سیستم CRISPR/Cas در جنس لوکونوستوک با استفاده از رویکرد In-silico. فصل‌نامه علمي ايمني زيستي. 1402; 16 (1) :15-36
