پژمردگی آوندی در خیار، ناشی از قارچ Fusarium oxysporum f. sp. cucumerinum (Foc)، یکی از عوامل مهم کاهش عملکرد این محصول در سطح جهانی است. کنترل این بیماری بسیار دشوار است و درک سازوکارهای مولکولی مقاومت برای تولید ارقام مقاوم، ضروری است. در این پژوهش، از الگوریتم انتخاب ویژگی لاسو (LASSO) روی داده‌های RNA-Seq  (با دسترسی PRJNA916850 ) برای شناسایی نشانگرهای زیستی کلیدی مرتبط با مقاومت یا حساسیت به Foc استفاده شد. این روش با حذف ژن‌های کم‌اهمیت، مجموعه‌ای کوچک و قابل تفسیر از مؤثرترین ژن‌ها را ارائه داد. چهار ژن کلیدی شناسایی شد: دو تنظیم‌کننده منفی (LOC101215771 و LOC101209793 )که حساسیت را افزایش می‌دهند، و دو تنظیم‌کننده مثبت (LOC101211117 و LOC101214807 )که در پاسخ دفاعی و مقاومت نقش دارند. نتایج نشان داد که تلفیق توالی‌یابی آر‌ان‌ای و الگوریتم لاسو، ابزاری مؤثر و کارآمد برای کشف نشانگرهای زیستی مرتبط با بیماری‌های گیاهی است. به‌کارگیری این ژن‌ها در برنامه‌های به‌نژادی، گامی اساسی برای تولید ارقام مقاوم، کاهش وابستگی به آفت‌کش‌ها، تضمین عملکرد پایدار و در نهایت، تقویت امنیت غذایی خواهد بود.