استادیار بخش بیوتکنولوژی میکروبی، پژوهشگاه بیوتکنولوژی کشاورزی ایران، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، کرج، ایران
چکیده: (2878 مشاهده)
پیشرفت در تعیین توالی نسل جدید نقش به‌سزایی در مطالعات مربوط به اکولوژی جمعیت‌های میکروبی داشته است. این پیشرفت‌ها منجر به توسعه سریع در تحقیقات متاژنومیکس (تحلیل دی.ان.ای جمعیت‌های میکروبی بدون نیاز به کشت) شده است. بسیاری از ابزارهای آماری و محاسباتی و پایگاه‌های اطلاعاتی متاژنومیکس منجر به کشف حجم عظیمی از داده‌ها شده است. در این تحقیق علاوه‌بر مرور روش تعیین توالی نسل جدید، ابزارها و روش‌های بیوانفورماتیک مورد استفاده، موارد مطالعه شده درباره میکروبیوم خاک‌های بازدارنده و دست ورزی میکروبیوم جهت مقابله با بیماری‌های گیاهی ارائه و مورد بحث قرار می‌گیرند. خاک بازدارنده به خاکی گفته می‌شود که در آنها با وجود حضور عوامل بیمارگر شناخته‌شده، شیوع بیماری‌های گیاهی بسیار کمتر است. توجه به ساختار و شناسایی دقیق میکروبیوم این خاک‌ها بسیار مورد علاقه طرفداران کاهش مصرف سموم شیمیایی است.
Abbasi S, Safaie N, Sadeghi A. Next Generation Sequencing and its Application in the Study of Microbiome in Plant Diseases Suppressive Soils. Journal of Biosafety 2021; 14 (1) :1-12 URL: http://journalofbiosafety.ir/article-1-400-fa.html
عباسی سکینه، صفایی ناصر، صادقی اکرم. توالی‌یابی نسل جدید و کاربرد آن در مطالعه میکروبیوم در خاک‌های مهارکننده بیماری‌های گیاهی. فصل‌نامه علمي ايمني زيستي. 1400; 14 (1) :1-12
